생물정보학과 정밀의학

기존에 연결해 놓은 CLI 의 구독이 있고 portal.azure.com 에서 새로운 구독을 만들었을 때에는 CLI 에서 ]$ az account list --all 를 시행하여도 기존 구독 리스트만 보인다. 이때에는 당연하지만 먼저 로그인을 한다. ]$ az login ]$ az account list --all 을 하면 새로 추가한 구독 리스트가 같이 보이게 된다. 구독 변경은 다음의 명령어로 한다. ]$ az account set ""

컴퓨터관련 쪽지 2021. 8. 25. 11:40

원문기사 https://www.sciencedaily.com/releases/2021/08/210802114943.htm Exercise improves health through changes on DNA Six weeks of physical exercise led to changes in the epigenetic information of skeletal muscle cells in young men. These changes took place in areas of the genome that have been linked to disease. Scientists say their research shows how exercise remodels D www.sciencedaily.com 오늘자 ..

건강 그리고 생물학 2021. 8. 5. 05:59

앞서서 python list를 내 원하는 우선순위로 정렬하기 위한 방법을 살펴보았다. 2021.03.30 - [컴퓨터관련 쪽지] - python list sorted 사용 시 내 마음대로 우선순위 정하기 python list sorted 사용 시 내 마음대로 우선 순위 정하기 기본적으로 python sort 에 대한 문서는 아래를 참고한다. docs.python.org/ko/3/howto/sorting.html 정렬 HOW TO — Python 3.9.2 문서 정렬 HOW TO 저자 Andrew Dalke와 Raymond Hettinger 배포 0.1 파이썬 리스.. phdeolee.tistory.com 이번에는 내가 원하는 정렬을 하는데 두가지 이상의 기준으로 정렬하는 방법을 알아보겠다. 위 메뉴얼에 ..

컴퓨터관련 쪽지 2021. 4. 1. 01:25

일단 코드를 보자 data = { "key1": {"subkey1": {"value1": "100", "value2": 20}}, "key2": {"subkey1": {"value1": "20", "value2": 10}}, } ## value1 의 값중 최대값은 문자열이므로 "20" 이고 반환은 "key2" 를 한다. max_key1 = max(data, key=(lambda x: data[x]['subkey1']["value1"])) ## value2 의 값 중 최대값은 자연수 20이고 반환은 key1을 한다. max_key2 = max(data, key=(lambda x: data[x]['subkey1']['value2'])) 위 코드에서 max() 함수에 data 라는 이름의 사전을 넣어준다. 이..

컴퓨터관련 쪽지 2021. 4. 1. 01:01

기본적으로 python sort 에 대한 문서는 아래를 참고한다. docs.python.org/ko/3/howto/sorting.html 정렬 HOW TO — Python 3.9.2 문서 정렬 HOW TO 저자 Andrew Dalke와 Raymond Hettinger 배포 0.1 파이썬 리스트에는 리스트를 제자리에서(in-place) 수정하는 내장 list.sort() 메서드가 있습니다. 또한, 이터러블로부터 새로운 정렬된 리스트를 만 docs.python.org 이 글에서는 내가 원하는 우선순위를 가지고 python list 를 정렬하는 방법을 설명한다. 알아야 할 것은 sorted() 함수와 key 아규먼트이다. 해결하고자 하는 상황: 다음과 같은 list 가 있다. mylist = [("a",1),..

컴퓨터관련 쪽지 2021. 3. 30. 16:59

python unit test 를 pytest 로 이용할 때 내가 만든 스크립트에 대해서 test code 들이 모두 다 커버하고 있는지 확인할 필요가 있다. 이때는 pytest-cov 를 사용한다. 참조: Reporting — pytest-cov 2.11.1 documentation Reporting It is possible to generate any combination of the reports for a single test run. The available reports are terminal (with or without missing line numbers shown), HTML, XML and annotated source code. The terminal report without l..

컴퓨터관련 쪽지 2021. 3. 25. 13:28

작업환경: Ubuntu 디렉토리 구조 . ├── src │ ├── __init__.py │ └── foo.py └── test └── test_foo.py 위와 같은 구조에서 아래와 같이 pytest 를 하면 바로 에러가 발생한다. $ pytest test/ =============================================================================================== test session starts =============================================================================================== platform linux -- Python 3.8.5, pytest-6...

컴퓨터관련 쪽지 2021. 3. 25. 02:13

나의 경우 다음과 같은 경로를 가지고 있다. 이러한 상황에서 pylint 를 활성화 하면 test_*.py 에서 src 아래의 파일들을 경로를 찾지를 못한다. 이는 PYTHONPATH 에 src 가 들어가 있지 않기 때문이다. $ tree src test -L 1 src ├── __init__.py ├── details.py └── oneline.py test ├── test_details.py └── test_oneline.py 이를 위해서 .pylintrc 를 생성하고 init-hook='import sys; sys.path.append("./")' 를 해주면 문제가 해결 된다. .pylintrc 생성 ]$ pylint --generate-rcfile > .pylintrc PYTHONPATH에 roo..

컴퓨터관련 쪽지 2021. 3. 24. 11:39