생물정보학과 정밀의학

일단 우리가 아는 중심극한정리를 여기에 적어 본다. 표본평균의 표본분포에 관한 성질 모집단의 분포가 정규분포 $N(\mu,\sigma^2)$ 일 때 표본평균 $\bar{X}$ 는 정규분포 $N(\mu,\frac{\sigma^2}{n})$ 을 따른다. 한편 모집단의 분포가 정규분포가 아닌 경우에는 위의 사실이 성립하지 않는다고 한다. 하지만! 표본의 크기 n 이 충분히 클 때에는 임의의 모집단으로 부터의 표본평균이라 하더라도 그 분포가 정규분포에 가깝다는 것이 알려져 있는데 이것이 중심극한정리이다. 이것이 무슨 의미인지 간단한 python 코드와 그림으로 정리해 보겠다. import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt nnsize=10000 x1=np.random..

통계 2023. 10. 16. 08:00

생명과학 회사에 투자는 하고 싶은데 기초 지식은 없고 그렇다고 묻지 마 투자는 하기 싫은 사람들을 위해서 분자생물학에 대한 개념을 정리하고자 한다. 이번 글은 지난 글 생명과학에 투자 전에 개념부터 알자: 분자생물학 생명과학에 투자 전에 개념부터 알자: 거대분자 에 이어서 분자생물학의 마지막인 중심원리 (센트럴도그마, central dogma)에 대해서 정리하려고 한다. 앞의 글들에서 분자 생물학이란 생체내의 거대분자들인 핵산, 단백질, 지방, 탄수화물이 생명 활동에서 어떻게 서로 연관되어 기능을 하는지에 대한 학문이라고 정리하였고 이를 위해 핵산, 단백질, 지방, 탄수화물 각각이 어떤 역할을 하는지에 대해서 정리하였다. 그래서 마지막은 이들 거대분자들 중에서 생명의 정보를 전달하는 핵산과 단백질을 설명..

건강 그리고 생물학 2023. 10. 15. 08:00

생명과학 회사에 투자는 하고 싶은데 기초 지식은 없고 그렇다고 묻지 마 투자는 하기 싫은 사람들을 위해서 분자생물학에 대한 개념을 정리하고자 한다. 이번 글은 지난 글 생명과학에 투자 전에 개념부터 알자: 분자생물학에 이어서 거대분자의 개념을 정리하려고 한다. 우선 생명이라는 기능을 하기 위한 4개의 분자가 있다고 하였고 그들을 거대분자라고 한다고 설명하였다. 4개의 분자는 1. 핵산 2. 단백질 3. 지방 4. 탄수화물 이다. 결론적으로 이야기한다면 핵산은 유전정보를 담고 있는 저장물질로서 부모에서 자식으로 연결되는 생명의 정보 보관창고이다. 단백질은 이 핵산에 담겨 있는 유전정보를 해석하여 내 몸과 세포가 특정 기능을 하도록 하는 분자이다. 지방과 탄수화물은 세포를 구성하고 에너지원으로 사용되는 분자..

건강 그리고 생물학 2023. 10. 10. 08:00

생명과학 회사에 투자는 하고 싶은데 기초 지식은 없고 그렇다고 묻지 마 투자는 하기 싫은 사람들을 위해서 분자생물학에 대한 개념을 정리하고자 한다. 분자생물학 분자생물학은 이름에서 알 수 있듯이 분자 + 생물학으로 이루어진 개념으로 생물이라는 존재에 대해서 분자 수준에서 이해하고자 하는 학문이다. 이렇게 이야기하면 동어 반복 아니야라고 생각할 수 있기 때문에 좀 더 자세히 설명한다. 분자의 개념 분자라고 하는 것은 하나의 기능을 하는 최소 단위이다. 예를 들어 "물(H2O)"이라는 분자는 "산소(O)"와 "수소(H)"라는 원자의 구성으로 이루어져 있다. 즉 우리가 생존하는데 반드시 있어야 하는 물이라는 기능의 최소 단위는 물분자이고 이 물 분자를 이루기 위한 가장 기본 원소는 산소와 수소인 것이다. 그렇..

건강 그리고 생물학 2023. 10. 9. 08:00

배경: 채소기반의 식사는 서구에서 점점 유행하고 있고 정부와 건강 관련 단체들이 지원하고 있다. 하지만 치매 발병과의 관련성이 연구된 적은 없었다. 결과: 14.5년의 추적관찰 연구를 통해서 총 9,543명의 건강인 중 1,472명이 치매를 발병하였다. 채소기반식이인덱스(PDI)는 결과적으로는 치매 발병과 관련이 없는 것으로 관찰되었다. 하지만 APOE4 캐리어 남성의 경우에는 유의미하게 치매 발병 위험도가 낮아지는 것이 관찰되었다. 결론: 전반적으로는 채소기반 식이와 치매발병위험도는 관계가 없는 것으로 보이지만 고위험군의 경우에는 효과가 있는 것으로 볼 수 있다. 느낀 점: 이 결과를 통해서 유전자 검사를 통해 자신의 치매 발병 위험도를 사전에 인지할 경우 식이를 통해서 발병위험도를 낮출 수 있다는 생..

건강 그리고 생물학 2023. 9. 29. 08:00

이번 글에서는 최근에 발표된 논문을 소개해 보려고 한다. BMC Geriatrics (BMC 노인학) 학술잡지에 발표된 것으로 트라우마적 생애 사건(TLE. 정의 아래참고)과 치매발병의 위험도와의 상관관계를 메타연구(정의 아래참조) 한 결과이다. 배경: 전 세계적으로 치매 치료에 드는 비용은 1,000조 원 이상으로 추정이 된다. 2050년까지 치매환자가 1억 5천만 명을 넘을 것으로 예상되고 있는 가운데에 치매의 위험도를 높이는 원인을 알아내는 것이 의학적인 개입을 통해 위험도를 낮출 수 있는 근거를 마련할 수 있다. 결과: 총 3,523개의 연구를 검토하고 29개의 연구 논문을 문헌검토한 결과 총 7개의 연구를 메타연구에 포함시켜 결과를 도출하였다. 결과적으로 TLE는 치매의 위험도를 1.21배 높이..

건강 그리고 생물학 2023. 9. 28. 08:00

이번 글에서는 장수에 도움이 된다고 알려져 있는 찬물 샤워가 어떤 생체적인 기작에 따라서 그런 역할을 할 수 있는지를 정리해 보겠습니다. 찬물 샤워는 장수에서만 역할이 있는 것이 아니라 도파민 분비와도 관련이 있고 근육량을 늘리거나 살을 빼는 등 여러 가지 좋은 역할을 하는데요 이번 글에서는 노화와 관련되어서만 살펴보도록 하겠습니다. 추운 것이 장수에 도움이 된다고 하는데 어느 정도 추워야 할까요? 당연히 저체온증이나 동상과 같은 증상이 있을 정도의 추운 것도 문제이지만 소름이 돋고, 이빨이 딱딱거리며 팔이 떨리는 정도의 추위의 경계선에 있으면 갈색 지방이 활성화됩니다. 이때 인체에서 중요한 역할을 하는 조직이 갈색 지방 조직 (BAT, brown adipose tissue)입니다. 갈색 지방은 에너지 ..

건강 그리고 생물학 2023. 9. 22. 08:01

아래 글은 https://www.sciencedirect.com/의 BDNF에 대한 자료모음집을 보고 정리한 글입니다. BDNF 란 무엇인가? BDNF 란 Brain Derived Neurotrophic Factor의 약자로 뇌유래신경영양인자로 번역한다. trophic이라는 말은 영양이라는 뜻이고 neuro라는 신경이라는 뜻의 접두어와 함께 사용되면서 신경영양이라는 뜻을 가지게 된다. 위 gif 파일에서 보면 색깔만 다른 똑같이 생긴 단백질 두 개가 붙어 있는 것을 볼 수 있는데 이렇게 짝을 이루어 활동을 한다. 1982년에 병아리 배아세포에서 감각뉴런을 배양할 때 처음으로 동정되었다. (Barde et. al. 1982). BDNF와 같은 신경영양인자는 NGF, BDNF, NT-3, NT-4/5 등이 ..

건강 그리고 생물학 2023. 9. 20. 22:00