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컴퓨터관련 쪽지16

vscode 에서 pylint 사용 나의 경우 다음과 같은 경로를 가지고 있다. 이러한 상황에서 pylint 를 활성화 하면 test_*.py 에서 src 아래의 파일들을 경로를 찾지를 못한다. 이는 PYTHONPATH 에 src 가 들어가 있지 않기 때문이다. $ tree src test -L 1 src ├── __init__.py ├── details.py └── oneline.py test ├── test_details.py └── test_oneline.py 이를 위해서 .pylintrc 를 생성하고 init-hook='import sys; sys.path.append("./")' 를 해주면 문제가 해결 된다. .pylintrc 생성 ]$ pylint --generate-rcfile > .pylintrc PYTHONPATH에 roo.. 2021. 3. 24.
yahoo mail 을 outlook 에 연결하기 (임시 비밀번호 생성) 인터넷이 대중화 된 것이 우리나라에서 1997년이다. 이때부터 수 많은 이메일 서비스들이 존재해 왔다. hotmail, hanmail, yahoo, netian, msn, paran 등등 내가 가입했던 이메일 서비스만 해도 이렇게 여러개인데 거의다 사라지고 아직까지 남아 있는 것은 yahoo 밖에 없다. hanmail 과 hotmail 은 한 때 이메일계를 호령하였으나 유료화 등등의 이슈로 결국은 사라지고 지금은 거의 gmail 을 사용하던가 naver를 사용하고 있다. yahoo 는 보안을 위해 요즘은 비밀번호 인증을 하지 않고 연동된 스마트폰 앱에서 로그인 허용을 하여 로그인을 하기 때문에 비밀번호를 사용하지 않는다. 하지만 outlook 에서는 여전히 비밀번호를 요구하고 있기 때문에 곤란한 문제가 .. 2021. 3. 24.
[Azure, jupyter] Azure 클라우드에서 jupyter 서버열고 외부에서 접속하는 방법 X를 이용하여 X forwarding을 하면서 분석을 할 수도 있지만 jupyter를 이용하여 접근하는 것이 더 깔끔할 것 같아 설정해 보았다. 우선 conda 를 이용해서 jupyter-lab을 설치한다. 그다음 jupyter 설정 파일을 만든다. jupyter-lab --generate-config jupyter_lab_config.py 를 실행한다. 이렇게 해서 jupyter 용 configure 파일을 만든 다음 config.py 에서 다음을 변경한다. '*'는 모든 ip 로부터의 접근을 허용한다는 의미이므로 ip를 제한하고 싶으면 해당 ip 만 적어주도록 한다. ## The IP address the Jupyter server will listen on. # Default: 'localhost'.. 2021. 3. 22.
[pandas, matplotlib] bed 파일을 읽어 들여서 모두 한번에 line plot 하기 코드 import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt import glob def gen_readcnt_df(file_list): """ file_list: bed 파일에 대한 리스트 bed file 형식: chrname시작끝영역내read의 갯수 특별히 bed 에는 header 행은 없는 상태임 """ res = None for bed in file_list: colname = bed.split("/")[-1].split(".")[0] aa = pd.read_csv(bed, sep="\t", header=None, index_col=(0,1,2), names=("chrn","init","end",colname)) if res is None: res = aa e.. 2021. 3. 22.

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